In opdracht van Stadsherstel Amsterdam is de Bakenesserkerk, die niet meer als kerk in gebruik is, gerestaureerd en ingericht ten behoeve van de archeologische dienst van de gemeente Haarlem. Het dak is voorzien van natuurstenen leien en ook de goten, het metselwerk en de glas-in-loodramen zijn hersteld. Binnenin de kerk is de entree gewijzigd en zijn de banken verplaatst. Tevens zijn er nieuwe installaties, verwarming en elektra met zonnepanelen aangebracht.

Na een jaar restaureren is het kerkgebouw herbestemd tot kantoor. De Bakenesserkerk is ook ingericht als expositieruimte voor kleine, tijdelijke exposities met vondsten uit de Haarlemse bodem. In de Bakenesserkerk is een glazen afscheiding met vitrines gebouwd. Hierdoor ziet men vanaf binnenkomst het gehele gebouw.